Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms