Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms