Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms