Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms