Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXBP1Q9Y5B6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms