Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIGD1AQ9Y241 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms