Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms