Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA3Q9UL41 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA3Q9UL41 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA3Q9UL41 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA3Q9UL41 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA3Q9UL41 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA3Q9UL41 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA3Q9UL41 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA3Q9UL41 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA3Q9UL41 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA3Q9UL41 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA3Q9UL41 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA3Q9UL41 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA3Q9UL41 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA3Q9UL41 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA3Q9UL41 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA3Q9UL41 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA3Q9UL41 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA3Q9UL41 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms