Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL4Q9UJQ4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms