Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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