Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms