Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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SH3BP4Q9P0V3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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SH3BP4Q9P0V3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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SH3BP4Q9P0V3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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SH3BP4Q9P0V3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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