Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NKIRAS2Q9NYR9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms