Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDE1Q9NXR1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms