Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms