Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A2Q9NTI2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP8A2Q9NTI2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP8A2Q9NTI2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP8A2Q9NTI2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP8A2Q9NTI2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8A2Q9NTI2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8A2Q9NTI2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8A2Q9NTI2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8A2Q9NTI2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8A2Q9NTI2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8A2Q9NTI2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8A2Q9NTI2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8A2Q9NTI2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8A2Q9NTI2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8A2Q9NTI2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8A2Q9NTI2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8A2Q9NTI2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8A2Q9NTI2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8A2Q9NTI2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8A2Q9NTI2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8A2Q9NTI2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8A2Q9NTI2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms