Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms