Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms