Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF408Q9H9D4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms