Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms