Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms