Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PCGF6Q9BYE7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms