Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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MAP1LC3CQ9BXW4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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MAP1LC3CQ9BXW4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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MAP1LC3CQ9BXW4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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MAP1LC3CQ9BXW4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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