Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms