Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms