Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms