Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms