Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms