Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms