Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms