Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms