Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms