Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAMP4Q969E2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms