Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms