Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U1

Putative uncharacterized protein LOC400692, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N3U1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q8N3U1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q8N3U1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q8N3U1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8N3U1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8N3U1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8N3U1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8N3U1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8N3U1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8N3U1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8N3U1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8N3U1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8N3U1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8N3U1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8N3U1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8N3U1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8N3U1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8N3U1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8N3U1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8N3U1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8N3U1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8N3U1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8N3U1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8N3U1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8N3U1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8N3U1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8N3U1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8N3U1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8N3U1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8N3U1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8N3U1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8N3U1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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