Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms