Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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