Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q71RC1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q71RC1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q71RC1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q71RC1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q71RC1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q71RC1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q71RC1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q71RC1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q71RC1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q71RC1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q71RC1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q71RC1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q71RC1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q71RC1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q71RC1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q71RC1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q71RC1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q71RC1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q71RC1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q71RC1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q71RC1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q71RC1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q71RC1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q71RC1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q71RC1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q71RC1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q71RC1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q71RC1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q71RC1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q71RC1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q71RC1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q71RC1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q71RC1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q71RC1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q71RC1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms