Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP43Q70EL4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP43Q70EL4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP43Q70EL4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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