Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CD109Q6YHK3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CD109Q6YHK3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms