Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
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