Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC1

JMJD6, Bifunctional arginine demethylase and lysyl-hydroxylase JMJD6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD6Q6NYC1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
JMJD6Q6NYC1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
JMJD6Q6NYC1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
JMJD6Q6NYC1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
JMJD6Q6NYC1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD6Q6NYC1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD6Q6NYC1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD6Q6NYC1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD6Q6NYC1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD6Q6NYC1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD6Q6NYC1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD6Q6NYC1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD6Q6NYC1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD6Q6NYC1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD6Q6NYC1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD6Q6NYC1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD6Q6NYC1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms