Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3F3CQ6NXT2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms