Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL1Q5VZK9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms