Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MALRD1Q5VYJ5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms