Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HDGFL1Q5TGJ6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HDGFL1Q5TGJ6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HDGFL1Q5TGJ6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDGFL1Q5TGJ6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDGFL1Q5TGJ6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDGFL1Q5TGJ6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDGFL1Q5TGJ6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDGFL1Q5TGJ6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDGFL1Q5TGJ6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDGFL1Q5TGJ6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HDGFL1Q5TGJ6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDGFL1Q5TGJ6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDGFL1Q5TGJ6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDGFL1Q5TGJ6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDGFL1Q5TGJ6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDGFL1Q5TGJ6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDGFL1Q5TGJ6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDGFL1Q5TGJ6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms