Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms