Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN4Q56A73 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPIN4Q56A73 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPIN4Q56A73 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPIN4Q56A73 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPIN4Q56A73 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPIN4Q56A73 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPIN4Q56A73 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPIN4Q56A73 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPIN4Q56A73 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN4Q56A73 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN4Q56A73 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms