Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT24Q2M2I5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms