Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX7Q2KHR2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms